Quiero incorporar Cloudflare pero tengo apuntadas mis DNS a Webempresa  

Hola

Revisa el siguiente artículo en la parte final se explica la configuración con cloudflare, efectivamente tienes que cambiar las DNS pero antes tienes que hacer el proceso de registro y detección

https://www.webempresa.com/blog/cdn-wordpress.html

Saludos.

creo que no resuelve las dudas que te comento al cambiar las dns es obvio que ya no apuntaría mi pagina a webempresa y qué pasaría entonces con mi pagina ya que cloudflare es un proxy y con webempresa tengo alojadas mis paginas e incluso certificados SSL, quisiera tener mis dominios igual con webempresa pero no es posible ya que algunos son .mx, . com .com.mx, y mi única forma de apuntar mis dominios es mediante dns e ip en algunos

Hola

Cloudflare te redireccionará, seguirás con https de Webmpresa, pero tienes que cambiar las DNS de tu dominio y apuntar a CloudFlare, no hay otra opción si quieres usar CloudFlare como proxy. CloudFlare almacena las páginas estáticas de tu sitio en cache y las sirve, las páginas dinámicas se seguirán sirviendo de Webempresa.

Evalúa si realmente vale la pena tener CloudFlare, es especialmente útil si tienes un alto volumen de visitas y tu hosting no lo soporta correctamente o notas cortes o lentitd ( en Webempresa si que se soporta) y estas visitas son de Ips extranjeras. Si aún quieres configurar cloudflare te sugiero consultar con tickets de soporte en donde te pueden dar detalles adicionales.

Saludos.