Gestionar el estado de los pedidos: automatizar? Actualizar sin enviar e-mail y otros  

Hola Alceste.

¿Hay alguna manera de actualizarlo? Es decir, ¿se podría hacer que a las 48 horas de confirmarse un pedido el estado cambiara automáticamente a Enviado?

No, no se puede a no ser que se programara esa opción. tienes que cambiar los estados manualmente.
Imagínate una situación en la que el cliente decide pagar por Transferencia bancaria y pasados esas 48 horas no envía el justificante, el pedido pasaría directamente a Enviado, cuando el pedido tendría que estar en espera o avisar al cliente de que no se recibió el justificante del pago.

¿Hay alguna manera de actualizar en masa (no uno por uno) el estado de los pedidos sin que envíe un correo al comprador?

En Estados de pedido tienes la opción de indicar si si quieres que se avise al comprador del cambio de estado:

Otra opción sería crear un nuevo estado de pedido por ejemplo " Pedido Cerrado " y asignar a ese estado los pedidos terminados.

Un saludo

Hola,
El cambio automático a Enviado solo lo contemplaba de Estado Confirmado a Enviado. (No de Pendiente o de Confirmado por comprador, de manera que el pago estaría asegurado). De todos modos, si no se puede la solución que planteas de crear un nuevo estado de pedido me parece la mejor.
Nota: Lo de indicar que no mande el e-mail al comprador al actualizar el pedido estaría bien, pero creo que lo he intentado en anteriores ocasiones y ha mandado una notificación al cliente igualmente. De ahí la consulta.
Saludos y gracias