Los pedidos se quedan en "Pendiente de Pago"  

Adjunto aquí las capturas de pantalla.

Hola Antonio.

Veo que tienes unos valores en los parámetros de PHP muy bajos.

.- Accede a tu cuenta de WePanel -> Otras herramientas -> Parámetros de PHP

.- Modifica los valores como los que tienes en esta captura:

Una vez tengas:

.- Accede a Fragmentos de Código -> Añadir nuevo

.- Añade un titulo para tenerlo identifica y añade lo siguiente:

add_action('woocommerce_thankyou', 'we_autocomplete_virtual_orders', 10, 1);
function we_autocomplete_virtual_orders($order_id) {
if (!$order_id) return;

$order = wc_get_order($order_id);
$items = $order->get_items();
$only_virtual = true;

foreach ($items as $item) {
$product = wc_get_product($item['product_id']);
if (!$product->is_virtual() && !$product->is_downloadable()) {
$only_virtual = false;
break;
}
}

if ($only_virtual) {
$order->update_status('completed');
}
}

Este código marca automáticamente como completado cualquier pedido donde todos los productos sean virtuales o descargables después de finalizar la compra.

Revisa si con eso se soluciona y nos comentas.

Un saludo