Cómo Traslado un subdominio a dominio principal

Ya tenemos prácticamente una nueva web con versión actualizada de prestashop en el subdominio que ustedes nos facilitaron en nueva.dvillena.com, pero la anterior sigue funcionando en dvillena.com
La cuestión es: ¿ cómo hacer para eliminar (previa copia seguridad obviamente) el anterior contenido de public_html y sustituirlo por el subdominio que está dentro también de public_html nueva.dvillena.com ?
¿ Hago fichero zip con el contenido de nueva.dvillena.com me lo copio a mi ordenador y posteriormente lo subo tras limpiar el public_html ?
¿ O tiene su administrador de ficheros alguna utilidad para mover un directorio a un nivel superior por ejemplo ?

Queda claro que hay que hacer cambios en .htacces del directorio principal así como algún cambio en las url de la nueva tienda.

La cuestión es que entiendo que no puedo usar herramientas de traslado de webs que a veces se han propuesto (y existen) ya que estamos en el mismo servidor.

Cualquier ayuda es bienvenida,

Gracias.

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